Nel cuore della bassa Lombardia, immerso negli scenari agresti della Pianura Padana, San Martino dall'Argine si colloca lungo la destra orografica dell'Oglio. Corsi d'acqua ben regimentati, riviere boscose e campi geometrici. Il corso placido del fiume ha plasmato nei secoli la fisionomia dell'intera area, avvicendando piene, esondazioni e la sapiente attività di regimentazione dell'uomo.
San Martino sorge sul margine di un antico argine naturale e la morfologia del territorio è tipica degli insediamenti umani di origine preistorica.