La Estación San Francisco es una de las 13 estaciones donde se ha concluido la obra civil. Se estima que esta Estación recibirá diariamente 40 mil pasajeros.
La construcción de la Estación San Francisco inició en abril del 2016 con el retiro de las piedras de la Plaza, que fueron codificadas y guardadas en las bodegas del Instituto Metropolitano de Patrimonio (IMP), cumpliendo con normativas y técnicas de preservación patrimonial.