Secara topografi, Muara Enggelam merupakan desa terpencil, karena lokasinya yang sangat jauh dari kota. Satu-satunya transportasi yang dapat diandalkan untuk mencapai desa ini hanyalah perahu. Seperti desa terapung pada umumnya, masyarakat desa Muara Enggelam tinggal di rumah-rumah apung atau juga sering disebut rumah rakit.