El LAMA inició sus actividades en 1993, al crearse la Coordinación Mazatlán en Acuicultura y Manejo Ambiental, del Centro de Investigación en Alimentación y Desarrollo A.C. (CIAD-Mazatlán), enfocando su investigación en temas relativos a la pesca y el impacto de la camaronicultura, entonces incipiente.

Actualmente, las líneas de investigación que definen la actividad del LAMA, están abiertas a sistemas y recursos costeros en general, habiendo desarrollado más de 30 proyectos de investigación, en los que la pesca, la acuicultura (camaronicultura principalmente) y los humedales costeros, fueron los principales objetos de estudio.

El desarrollo de la investigación ha seguido distintos enfoques, que incluyen su dinámica y estructura, ordenamiento y más recientemente, la evaluación de servicios ecosistémicos y vulnerabilidad ante el cambio global, teniendo a la percepción remota y a los sistemas de información geográfica, como principales herramientas de estudio. Se presenta un resumen de los proyectos con mayor incidencia en el área de ciencias del mar y limnología, que pueden ser de interés para la comunidad interesada en estos temas y propiciar posibles colaboraciones interinstitucionales.