Terbang dari Bajawa ke Kupang ada tersedia 3 jadwal penerbangan. jadwal penerbangan pertama biasanya pukul 09.00 WITA. sedangkan penerbangan kedua sekitar pukul 12.00 WITA dan penerbangan ketiga biasanya pukul 14.00 WITA. Namun terkadang jadwal penerbangan terjadi perubahan tergantung situasi dan kondisi.